目前原料藥生產(chǎn)的廢水大多采用生化方法進(jìn)行處理。生化處理法可分為厭氧生物處理和需氧生物處理，分別通過厭氧微生物和好氧微生物的共同作用，以降解廢水中的有機(jī)污染物，使廢水得以凈化。

由于原料藥生產(chǎn)過程產(chǎn)生的廢水含有一定的化學(xué)毒性和生物活性，特別是某些抗生素原料藥的生產(chǎn)廢水，其所含的抗生素具有較強(qiáng)的殺滅微生物的作用，會使得生化處理所需的厭氧和好氧微生物失效，達(dá)不到廢水處理的目的。另外由于這些物質(zhì)的高致敏性，如未經(jīng)降解處理會產(chǎn)生環(huán)境污染，對有過敏體質(zhì)的人群有威脅。如殘留于動植物中，還會通過食物鏈進(jìn)入人體對健康產(chǎn)生不利影響。

廢水中的這些活性和毒性物質(zhì)，可通過化學(xué)和物理的方法進(jìn)行降解，以降低和消除其毒性/活性。一種較常用的方法是酸堿處理法。由于化學(xué)毒性/生物活性物質(zhì)均為大分子長鏈結(jié)構(gòu)的有機(jī)物/蛋白質(zhì)，在強(qiáng)酸/強(qiáng)堿的作用下，有機(jī)長鏈大分子結(jié)構(gòu)會被切斷而降解，這樣其活性/毒性也得到了緩解/消除。因此可通過調(diào)節(jié)廢水的pH值的方法，來改變和消除其毒性和活性。

但是，傳統(tǒng)的化學(xué)降解方法，加入鹽酸和氫氧化鈉的過程大多采用人工操作，整個過程均暴露于環(huán)境中，加入酸堿的數(shù)量和方式、操作員工的防護(hù)措施、降解結(jié)果的判斷均不完善，存在很大的改進(jìn)空間。這種原料藥廢水處理的缺點是：

1.間歇操作，廢水處理池體積膨大;

2.廢水池敞開，易受雨水影響，溢流造成污染;

3.降解液人工加入，計量不精確;

4.處理終點不能有效控制。

因此，采用“SBR+接觸氧化”二級好氧工藝。具體原料藥廢水處理方法是：首先格柵去除廢水中較大的雜質(zhì)及懸浮物，然后進(jìn)入調(diào)節(jié)池調(diào)節(jié)水質(zhì)水量，再水解酸化對COD、BOD進(jìn)行去除，提高廢水的可生化性。在SBR反應(yīng)池中進(jìn)行微生物降解有機(jī)物及固液分離，然后進(jìn)入接觸氧化池中，與生物膜接觸，生物膜與懸浮的活性污泥共同作用，達(dá)到凈化廢水的作用。