Cyber Safe凝膠電泳染料 是一種用于觀測DNA瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠新一代染料,其使用特殊的合成工藝,與傳統(tǒng)的溴乙錠(EB) 染料相比具有更高的靈敏度,且?guī)缀鯖]有致突變性,是新的EB替代染。該染料與DNA結(jié)合后,可使用紫外-可見分光光度計或激光光源的設(shè)備觀測。Cyber Safe凝膠電泳染料也可用于RNA 凝膠染色。Cyber Safe DNA凝膠電泳染料在280nm 和502nm有Z大激發(fā)波長,與DNA結(jié)合后的Z大發(fā)射波長是530nm。
實驗方案
1.電泳后染色
1.1按常規(guī)方法制備瓊脂糖凝膠,膠中不能含任何其他染料。
1.2把保存于DMSO中的10000X Cyber Safe DNA凝膠電泳染料用TAE或TBE 緩沖液按1:10000稀釋成1X Cyber Safe DNA 凝膠電泳染料(比如把10 μL Cyber Safe 用 TAE or TBE 緩沖液稀釋到100mL).
1.3染色: 用塑料容器裝適量 1X Cyber Safe 染色液,染色液淹沒凝膠即可。一般情況下,50mL染色液足以滿足常規(guī)的小塊凝膠,對于較大的凝膠,適量增加染色液用量,確保整塊凝膠浸入液面下.
注意:染色容器不要使用玻璃器皿,因為染料會吸附在玻璃器皿的內(nèi)壁,影響色效果。
1.4浸泡的凝膠室溫下放置30分鐘 (染色時間因凝膠濃度和厚度而定),用鋁箔蓋住容器或置于暗室避光,輕微搖動染色容器(50rpm),不需脫色處理。
1.5在254 nm紫外照射透視下,與雙鏈DNA結(jié)合的Cyber Safe呈現(xiàn)綠色熒光。拍照時最好使用綠色濾光片。也可使用300 nm紫外照射透視儀或藍光透照儀觀察。
2.電泳中染色 (僅適于瓊脂糖凝膠電泳)
2.1直接用1X Cyber Safe DNA凝膠電泳染料(見1.2)與適量瓊脂糖粉末配制凝膠。例如, 要配制25ml熔融的瓊脂糖凝膠,可直接在 25ml 1X Cyber Safe中加入適量瓊脂糖粉末,搖勻加熱。
注意:預(yù)制含 Cyber Safe 的凝膠,與配制EB凝膠一樣需微波爐加熱,結(jié)合了Cyber Safe的DNA片段電泳時會比未結(jié)合染料的DNA片段走的稍慢,這也與EB染料的情況一樣。
2.2電泳: 按常規(guī)操作, 電泳后不需要染色或脫色.
2.3在254 nm紫外照射透視下,與雙鏈DNA接合的Cyber Safe呈現(xiàn)綠色熒光。拍照時最好使用綠色濾光片。也可使用300 nm紫外照射透視儀觀察。