由主機產(chǎn)生高頻電場對水進行處理，使原有的大締合體狀態(tài)水的結(jié)合鍵被深度打斷，離解成活性很強的單分子或小締合體狀態(tài)的水，從而改變了水的物理結(jié)構(gòu)與特性，增強了水分子的極性，增大了水分子的偶極矩，提高了水分子對鈣鎂離子、碳酸根離子等成垢組份的水合能力，起到阻止水垢形成的作用。同時，在變頻電磁場的作用下，使原有的水垢結(jié)晶體逐漸變得松軟、脫落、溶解，從而達到除垢之目的。
高頻電磁場水應(yīng)用于防垢，是由于存在大量的“離子締合體”或“顆粒締合體”，在水溶液中提供了大量的結(jié)晶核心。結(jié)晶核心越多，生成的結(jié)晶數(shù)量也越多，水垢結(jié)晶的線性尺寸就越小。此外，由于單個或雙氫聯(lián)結(jié)的水分子數(shù)量增多，水分子的活動更“自由”，它占據(jù)水溶液的其它空隙，象形成極薄的膜一樣，因而阻礙晶體生長，促使水垢結(jié)晶線性尺寸減小，使水垢呈松軟的細小顆粒，隨排污水排除。 
        氧化腐蝕和垢下原電池腐蝕是水系統(tǒng)管道及設(shè)備腐蝕和生銹的主要原因，而在高頻電磁場作用下，水垢得以控制和去除，溶解氧與水分子結(jié)合不易析出，從而抑制氧化腐蝕和垢下原電池腐蝕的發(fā)生，起到良好的防腐阻銹的作用。
        另外，高頻電磁場使細菌、藻類賴以生存的環(huán)境被破壞，并且溶解氧在高頻電磁場的作用下形成一些如03、H202等對細菌、藻類具*殺傷力的物質(zhì)，起到殺菌滅藻的作用。