DNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(熒光型)使用說明書
(貨號:WLE8202KIT)
原理概述:
本試劑盒基于一種常溫恒溫核酸快速擴(kuò)增技術(shù):在常溫恒溫下,重組酶和引物形成蛋白/單鏈核苷酸的復(fù)合體Rec/ssDNA,在輔助蛋白和單鏈結(jié)合蛋白SSB的幫助下,侵入雙鏈DNA模板;在侵入位點(diǎn)形成D-loop區(qū)域,并開始對DNA雙鏈進(jìn)行掃描;待找到與引物互補(bǔ)的目的區(qū)域后,復(fù)合體Rec/ssDNA解體的同時(shí),聚合酶也結(jié)合到引物的3’末端,開始鏈的延伸。本試劑盒在39 ºC下,依賴核酸外切酶的作用,加入根據(jù)模版設(shè)計(jì)的特異的分子探針,使用熒光監(jiān)測設(shè)備能實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)片段擴(kuò)增過程的實(shí)時(shí)監(jiān)控。
產(chǎn)品特點(diǎn):
本試劑盒具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、反應(yīng)時(shí)間短(僅需20 mins)等優(yōu)點(diǎn),反應(yīng)組分為干粉狀態(tài),操作簡便,易于保存。
可適用于各種品牌的熒光定量PCR儀、恒溫?zé)晒鈹U(kuò)增儀器等熒光檢測設(shè)備。
引物設(shè)計(jì):
建議使用長度在30-35 bp的引物,引物過短會(huì)影響擴(kuò)增速度和檢測靈敏度;引物設(shè)計(jì)避免形成二級結(jié)構(gòu)而影響擴(kuò)增;擴(kuò)增子長度建議在150-300 bp,通常不超過500 bp。
熒光探針設(shè)計(jì):
探針序列不與特異性引物識別位點(diǎn)重疊,長度為46-52 nt,序列避免回文序列、內(nèi)部二級結(jié)構(gòu)和連續(xù)的重復(fù)堿基。探針共有四個(gè)修飾位點(diǎn):距離5’端的≥35 nt的中部位置標(biāo)記一個(gè)dSpacer(,THF),作為核酸外切酶的識別位點(diǎn);THF位點(diǎn)的上游標(biāo)記一個(gè)熒光基團(tuán),下游標(biāo)記一個(gè)粹滅基團(tuán),兩個(gè)基團(tuán)的間距為2-4 nt;THF距離3’末端≥15 nt,并且3’末端標(biāo)記一個(gè)修飾基團(tuán),例如胺基、磷酸基團(tuán)或C3-Spacer。
試劑盒組成:
組成 | 含量 |
A buffer | 1.6 mL×1管 |
B buffer | 150 μL×1管 |
正對照模板 | 30 μL×1管 |
正對照引物探針Mix | 70 μL×1管 |
試劑 | 48份 |
使用說明書 | 1份 |
試劑盒儲存:
運(yùn)輸條件:低溫運(yùn)輸;
儲存條件:儲存溫度 ≤ -20 ºC,避光保存,避免重壓、反復(fù)凍融;
產(chǎn)品有效期:12個(gè)月。
操作步驟:提前30分鐘將試劑盒所需組分取出,室溫融化,震蕩混勻。
1) 每個(gè)干粉反應(yīng)管加入29.4 μL A buffer(注意:A buffer需*融化混勻,否則會(huì)對實(shí)驗(yàn)效果產(chǎn)生影響);
2) 每個(gè)反應(yīng)管分別加入2 μL上游引物、2 μL下游引物和0.6 μL探針(引物和探針濃度為10 μM,對于多個(gè)反應(yīng)、步驟1和步驟2可以混合后再分裝至反應(yīng)管中);
3) 向反應(yīng)管中依次加入11.5 μL ddH2O和2 μL核酸模板(可根據(jù)核酸濃度調(diào)整加入的核酸模板體積,并相應(yīng)調(diào)整加入的ddH2O體積,至模板與ddH2O總體積為13.5 μL);
4) zui后向反應(yīng)管中加入2.5 μL B buffer并充分混合(對于多個(gè)反應(yīng),建議將B buffer加至反應(yīng)管的蓋子內(nèi)側(cè),上下顛倒反應(yīng)管8-10次混勻);
5) 混勻后,將反應(yīng)液甩(或快速離心)至管子底部,然后立即將反應(yīng)管放入熒光檢測設(shè)備中。熒光檢測程序設(shè)置為:恒溫39 ºC;每30 s采集一次FAM通道(信號采集通道的選擇與熒光探針設(shè)計(jì)一致)熒光值;反應(yīng)時(shí)間20 mins。
注:如使用ABI系列PCR儀,請務(wù)必于passive reference和quencher處均選擇“none”。
體系配制 正對照熒光結(jié)果圖
組分 | 體積(μL) |
A buffer | 29.4 2 |
上游引物(10 μM)* | |
下游引物(10 μM)* | 2 |
探針(10 μM)* | 0.6 |
ddH2O 和DNA模板 | 13.5 |
B buffer | 2.5 |
總體積 | 50 |
*正對照反應(yīng)單元體系配制:正對照模板加入2μL,引物與探針加入4.6 μL正對照引物探針Mix(已包含探針和上/下游引物),其他組分參照體系配制。
N:陰性對照; P:正對照 |
注意事項(xiàng):
1. 由于試劑盒靈敏度非常高,在進(jìn)行反應(yīng)時(shí)請注意避免微量核酸污染,并盡量考慮設(shè)置空白對照以確認(rèn)是否有核酸污染。
2. 試劑盒保質(zhì)期12個(gè)月。每次使用時(shí),請取出實(shí)驗(yàn)所需的MIRA反應(yīng)單元的數(shù)量,置于冰浴條件下并在8小時(shí)內(nèi)使用;剩余部分,請置于存儲條件下。
DNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(基礎(chǔ)型) | WLB8201KIT | 48份/盒 | 3300 |
DNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(熒光型) | WLE8202KIT | 48份/盒 | 3300 |
DNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(膠體金試紙條型) | WLN8203KIT | 48份/盒 | 3300 |
RNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(膠體金試紙條型) | WLRN8206KIT | 48份/盒 | 3360 |
RNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(基礎(chǔ)型) | WLRB8204KIT | 48份/盒 | 3360 |
RNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(熒光型) | WLRE8205KIT | 48份/盒 | 3360 |
HybriDetect試紙條 | WLFS8201 | 50條/包 | 1800 |