組織細(xì)胞microRNA提取試劑盒

描述：生產(chǎn)的組織細(xì)胞 miRNA 提取試劑盒是目前世界 上提取小 RNA（<200nt）操作步驟重復(fù)性、 小 RNA 產(chǎn)率的方法。使用該試劑盒提取的小 RNA （Small RNA）中，長度在 15～200nt 范圍的 RNA 在 95% 以上，基本不含有大 RNA 和 DNA。使用該試劑通過一步上 柱即可獲得高純度 miRNA，可在 45min 內(nèi)完成小 RNA 的提 取。該試劑盒廣泛適用于動(dòng)物組織、細(xì)胞和多糖多酚含量不 高的植物組織樣本。

儲(chǔ)存：室溫可保存 2 年。

使用防護(hù)建議：miRNA Reagent A 溶液中含有胍鹽，其具有 強(qiáng)烈的腐蝕性，試驗(yàn)時(shí)請(qǐng)務(wù)必佩戴防護(hù)眼鏡、手套、口罩等 防護(hù)措施，如有皮膚接觸請(qǐng)立即用大量清水沖洗，再另行就 醫(yī)。
操作方法： 1. 組織樣本提取 (1) 向 1.5ml EP 管中加入 300μl miRNA Reagent A。植物組 織則再加入 10μl β-巰基乙醇，混合均勻。 (2) 在液氮條件下充分將組織研磨粉碎，將一定的樣品量（見 樣本使用量表）研磨成粉狀的組織加入到上述 300μl miRNA Reagent A 中，立即手腕用力震蕩至組織粉末溶解于裂 解液中。室溫靜置 5min 以充分裂解細(xì)胞。 注意：將組織加入到 miRNA Reagent A 后要迅速將組織震散，否 則易引起組織成團(tuán)狀，不容易裂解。如發(fā)生成團(tuán)狀，務(wù)移液器 將團(tuán)狀組織吹打松散。 (3) 向上述裂解完畢的裂解液中加入 350μl miRNA Reagent B，上下顛倒混合均勻。13,000rpm 離心 5min，吸取 550μl 上清液，轉(zhuǎn)移到新的 1.5ml EP 管中。 (4) 向上述溶液中加入 200μl 無水乙醇，手腕用力震蕩數(shù)次， 室溫放置 5min。 (5) 13,000rpm 離心 10min，轉(zhuǎn)移 700μl 上清液到新的 1.5ml EP 管中。 (6) 向上述溶液中加入 300μl 異丙醇，手腕用力上下顛倒數(shù) 次。 (7) 分兩次將上述溶液倒入到 miRNA 吸附柱中，13,000rpm 離心 1min，倒掉過濾液。 (8) 向吸附柱中加入700μl 75%異丙醇洗滌一次，13,000rpm 離心 1min，倒掉過濾液。 (9) 向吸附柱中加入 500μl 無水乙醇洗滌一次，13,000rpm 離心 1min，倒掉過濾液。 (10) 吸附柱 13,000rpm 空離心 2min，去掉殘留的乙醇。 (11) 將吸附柱放入到新 1.5ml EP 管中，室溫放置 2min，使 殘留乙醇揮發(fā)。在吸附柱濾芯上加入 30μl RnaseFree TE Buffer，室溫靜置 2min，13,000rpm 離心 2min，洗脫產(chǎn)物 即為提取的 miRNA。（通常取 1～2μl 該產(chǎn)物，即可使用 一步法 miRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)，

2. 細(xì)胞樣本提取 (1) 貼壁細(xì)胞：消化細(xì)胞后，離心收集細(xì)胞沉淀。用 100μl 1×PBS 重懸細(xì)胞后，加入 300μl miRNA Reagent A 顛倒混 合均勻，室溫放置 5min。 (2) 懸浮細(xì)胞：直接離心后，收集細(xì)胞沉淀。用 100μl 1×PBS 重懸細(xì)胞后，加入 300μl miRNA Reagent A 顛倒混合均勻， 室溫放置 5min。 (3) 向上述裂解完畢的裂解液中加入 250μl miRNA Reagent B，上下顛倒混合均勻。13,000rpm 離心 5min，吸取 550μl 上清液，轉(zhuǎn)移到新的 1.5ml EP 管中。 注意：加入細(xì)胞體積數(shù)與 miRNA Reagent B 總體積數(shù)為 350μl。如加入 50μl細(xì)胞，則 miRNA Reagent B使用 300μl。 (4) 向上述 550μl 上清溶液中加入 200μl 無水乙醇，手腕用 力震蕩數(shù)次，室溫放置 5min。 (5) 13,000rpm 離心 10min，轉(zhuǎn)移 700μl 上清液到新的 1.5ml EP 管中。 (6) 向上述溶液中加入 300μl 異丙醇，手腕用力上下顛倒數(shù) 次。 (7) 分兩次將上述溶液倒入到 miRNA 吸附柱中，13,000rpm 離心 1min，倒掉過濾液。 (8) 向吸附柱中加入700μl 75%異丙醇洗滌一次，13,000rpm 離心 1min，倒掉過濾液。 (9) 向吸附柱中加入 500μl 無水乙醇洗滌一次，13,000rpm 離心 1min，倒掉過濾液。 (10) 吸附柱 13,000rpm 空離心 2min，去掉殘留的乙醇。 (11) 將吸附柱放入到新 1.5ml EP 管中，室溫放置 2min，使 殘留乙醇揮發(fā)。在吸附柱濾芯上加入 30μl RnaseFree TE Buffer，室溫靜置 2min，13,000rpm 離心 2min，洗脫產(chǎn)物 即為提取的 miRNA。（通常取 1～2μl 該產(chǎn)物，即可使用 一步法 miRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)，。

常見問題匯總： (1) 本方法提取的小 RNA，95％以上為小 RNA（200nt 的 RNA，通常殘留的>200nt RNA 不影響后續(xù)試驗(yàn)操作。 (2) 本試劑盒提取的小 RNA 由于不含 mRNA 等大分子量的 RNA，因此更適合做后續(xù)反轉(zhuǎn)錄試驗(yàn)，從而進(jìn)行定量試驗(yàn)。 (3) 使用本試劑盒提取的 miRNA 濃度通常在 50ng/μl 左右， 取 5～10μl 即可用于電泳檢測。取 1~2μl 即可用于 HG TaqMan miRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)

一、模板DNA：PCR反應(yīng)需要模板DNA，如從細(xì)胞、組織、血液中提取DNA等；

二、引物：PCR反應(yīng)的兩個(gè)引物，分別與模板DNA的兩端配對(duì)擴(kuò)增所需的特定區(qū)域，引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物；

三、dNTPs：PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs，包括脫氧腺苷酸（dATP）、脫氧胸苷酸（dCTP）、脫氧鳥苷酸（dGTP）、脫氧胞嘧啶酸（dTTP），用于細(xì)胞分裂、DNA合成         等生物學(xué)過程，用于PCR擴(kuò)增的模板DNA鏈的延伸和擴(kuò)增；

四、Taq DNA聚合酶：PCR反應(yīng)需要的聚合酶，一般使用Taq聚合酶，還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等，用于擴(kuò)增DNA鏈；

五、PCR buffer溶液：對(duì)PCR反應(yīng)具有緩沖作用，調(diào)節(jié)反應(yīng)pH，硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機(jī)化合物如甲醛，可增強(qiáng)PCR反應(yīng)特異性，從而提高反應(yīng)效率；

六、酶切體系：PCR擴(kuò)增往往涉及到重組、構(gòu)建和測序等等實(shí)驗(yàn)步驟，常常需要進(jìn)行酶切操作。

七、MARK:一種分子量標(biāo)準(zhǔn)，用來判別DNA片段大小的工具。

八、DNA純化試劑盒：用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物；

①Oligo dT
選擇Oligo dT時(shí)，要求RNA必須有Poly A，所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT，對(duì)RNA樣品的質(zhì)量要求較高，不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng)，建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。
②隨機(jī)引物
適合各種RNA的RT，尤其適合模板豐度很低的情況（比如某個(gè)gene表達(dá)量很低）。選擇隨機(jī)引物時(shí)，鏈cDNA合成反應(yīng)中就是以所有的RNA為模板，然后進(jìn)行PCR反應(yīng)時(shí)設(shè)計(jì)引物進(jìn)行特異性擴(kuò)增。同時(shí)要注意隨機(jī)引物的量和總RNA量之間的關(guān)系，一般建議每5µg總RNA的隨機(jī)引物的用量為50ng，如果每5µg總RNA的隨機(jī)引物的用量超過250ng，可能會(huì)導(dǎo)致小片段產(chǎn)物（＜500bp）的增加和長片段、全長產(chǎn)物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物（GSP）是某個(gè)基因序列的一部分，與模板互補(bǔ)的引物。該引物需要結(jié)合目標(biāo)RNA的已知序列進(jìn)行設(shè)計(jì)。由于引物和RNA序列特異性結(jié)合，每個(gè)目標(biāo)RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此，當(dāng)分析多種目標(biāo)時(shí)，則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同，所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物，建議對(duì)退火溫度進(jìn)行優(yōu)化。