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當(dāng)前位置:上海西格生物科技有限公司>>PCR相關(guān)試劑>>PCR相關(guān)>> 2XRAPA3GPCR Mix
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更新時(shí)間:2024-05-22 10:31:33瀏覽次數(shù):160次
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包裝 | 盒裝 | 用途 | 僅供科研研究實(shí)驗(yàn) |
2XRAPA3GPCR Mix
貨號(hào) | 規(guī)格 | 分類 |
XG-P2978 | 1ml | PCR相關(guān) |
XG-P2978 | 10ml | PCR相關(guān) |
RAPA3G DNA聚合酶為經(jīng)電子重構(gòu)架的第三代Taq DNA聚合酶,第三代DNA聚合酶具有高度的雜質(zhì)耐受性、長(zhǎng)片段擴(kuò)增能力、高擴(kuò)增成功率、高產(chǎn)量等特征,從而使得RAPA3G系列產(chǎn)品可用于粗制樣品的直接擴(kuò)增,無(wú)需核酸純化步驟。雜質(zhì)耐受性方面,該酶可耐受植物中的多糖多酚;全血、血清、血漿中的肝素、高濃度的血紅蛋白、甘油三脂;乙醇;胍鹽;SDS等強(qiáng)PCR抑制劑。在血液直擴(kuò)PCR實(shí)驗(yàn)中,RAPA3G PCR Mix性能與KAPA3G DNA聚合酶展現(xiàn)出同等的表現(xiàn),其性能表現(xiàn)優(yōu)于二代聚合酶(血液擴(kuò)增Hemo KlenTaq Mix)。在植物直擴(kuò)PCR實(shí)驗(yàn)中,RAPA3G PCR Mix在配合DNA釋放劑的條件下與KAPA3G Plant PCR試劑盒性能一致。 長(zhǎng)片段擴(kuò)增能力方面,使用該酶可輕松擴(kuò)增8kb的基因組片段,20kb的λ DNA,8kb的cDNA。該酶具有6kb/min以上的擴(kuò)增速度,可顯著的縮短PCR的擴(kuò)增時(shí)間,在常規(guī)測(cè)試條件下,10s的延伸時(shí)間可完成1kb的基因組DNA擴(kuò)增。在PCR擴(kuò)增成功率方面,與其它類型的PCR擴(kuò)增試劑對(duì)比中,RAPA3G PCR Mix表現(xiàn)出的PCR擴(kuò)增成功率。此外,該酶包含一定比例的RAPA HiFi超保真DNA聚合酶,因此其具有一定的保真性能(經(jīng)藍(lán)白斑測(cè)試,其保真性能約為Taq DNA聚合酶的56倍)。另外,RAPA3G系列產(chǎn)品均采用專有的熱啟動(dòng)技術(shù),確保50°C以下無(wú)活性,僅有95°C加熱5min以后才能恢復(fù)其活性,因此可限度的提高擴(kuò)增的特異性,減少非特異性產(chǎn)物的產(chǎn)生。該P(yáng)CR Mix具有5'-3'的聚合酶活性、5'-3'的外切酶活性和3'-5'的外切酶活性,產(chǎn)物部分帶有"A"尾巴,部分為平末端,因此產(chǎn)物均可用于TA克隆或平端克隆。 | ||||||||||||||||||||||||||
特征和用途 | ||||||||||||||||||||||||||
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RAPA3G DNA聚合酶對(duì)抑制物耐受性 | ||||||||||||||||||||||||||
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50μl體積建議添加的樣品量 | ||||||||||||||||||||||||||
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儲(chǔ)存 | ||||||||||||||||||||||||||
長(zhǎng)期儲(chǔ)存置于-20°C以下,可保存2年,避免反復(fù)凍融;短期使用置于4°C(3個(gè)月)保存,一經(jīng)融化后請(qǐng)放置于4°C,勿再凍存。 | ||||||||||||||||||||||||||
反應(yīng)實(shí)例 | ||||||||||||||||||||||||||
1. 模板適應(yīng)性強(qiáng),長(zhǎng)片段和短片段都可有效擴(kuò)增 | ||||||||||||||||||||||||||
Lane 1:λDNA 500bp, 2:λDNA 1kb, 3:λDNA 2kb, 4:λDNA 5kb, 5:λDNA 8kb, 6:λDNA 15kb, 7:λDNA 20kb, 8:human 500bp ,9:human 1kb, 10:human 2kb ,11:human 5kb, 12:human 8kb, 13:cDNA 166bp, 14:cDNA 552bp, 15:cDNA 960bp, 16:cDNA 1574bp, 17:cDNA 1705bp, 18:cDNA 2755b,p 19:cDNA 4128bp, 20:cDNA 7600bp, M:DNA Marker 10000 | ||||||||||||||||||||||||||
選取三種DNA模板,使用RAPA3G PCR Mix進(jìn)行擴(kuò)增,循環(huán)數(shù)統(tǒng)一為28 cycles,結(jié)果如上圖所示,對(duì)于不同種類DNA模板和不同長(zhǎng)度的靶基因,RAPA3G PCR Mix均有良好的擴(kuò)增性能。 | ||||||||||||||||||||||||||
2. 對(duì)于粗制樣品DNA具有的耐受性 | ||||||||||||||||||||||||||
分別以人全血、血清、葉片粗制品DNA以及大豆種子粗制品DNA為模板,使用RAPA3G PCR Mix進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果如上圖展示,各種粗制樣品都有良好的擴(kuò)增,其中全血和血清可耐受15%。 | ||||||||||||||||||||||||||
3.擴(kuò)增靈敏度高,λDNA模板低至0.1pg也可以有效擴(kuò)增 | ||||||||||||||||||||||||||
以λDNA為模板,選取不同模板使用量,采用RAPA3G PCR Mix進(jìn)行擴(kuò)增2kb靶基因,循環(huán)數(shù)統(tǒng)一為28 cycles,結(jié)果如上圖所示,λDNA模板低至0.1pg也可以有效擴(kuò)增 |
一、模板DNA:PCR反應(yīng)需要模板DNA,如從細(xì)胞、組織、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反應(yīng)的兩個(gè)引物,分別與模板DNA的兩端配對(duì)擴(kuò)增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過(guò)程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥(niǎo)苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細(xì)胞分裂、DNA合成 等生物學(xué)過(guò)程,用于PCR擴(kuò)增的模板DNA鏈的延伸和擴(kuò)增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反應(yīng)需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴(kuò)增DNA鏈;
五、PCR buffer溶液:對(duì)PCR反應(yīng)具有緩沖作用,調(diào)節(jié)反應(yīng)pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機(jī)化合物如甲醛,可增強(qiáng)PCR反應(yīng)特異性,從而提高反應(yīng)效率;
六、酶切體系:PCR擴(kuò)增往往涉及到重組、構(gòu)建和測(cè)序等等實(shí)驗(yàn)步驟,常常需要進(jìn)行酶切操作。
七、MARK:一種分子量標(biāo)準(zhǔn),用來(lái)判別DNA片段大小的工具。
八、DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物;
①Oligo dT
選擇Oligo dT時(shí),要求RNA必須有Poly A,所以真核生物的mRNA都適用。適合長(zhǎng)鏈甚至全長(zhǎng)mRNA的RT,對(duì)RNA樣品的質(zhì)量要求較高,不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng),建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。
②隨機(jī)引物
適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個(gè)gene表達(dá)量很低)。選擇隨機(jī)引物時(shí),鏈cDNA合成反應(yīng)中就是以所有的RNA為模板,然后進(jìn)行PCR反應(yīng)時(shí)設(shè)計(jì)引物進(jìn)行特異性擴(kuò)增。同時(shí)要注意隨機(jī)引物的量和總RNA量之間的關(guān)系,一般建議每5µg總RNA的隨機(jī)引物的用量為50ng,如果每5µg總RNA的隨機(jī)引物的用量超過(guò)250ng,可能會(huì)導(dǎo)致小片段產(chǎn)物(<500bp)的增加和長(zhǎng)片段、全長(zhǎng)產(chǎn)物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物(GSP)是某個(gè)基因序列的一部分,與模板互補(bǔ)的引物。該引物需要結(jié)合目標(biāo)RNA的已知序列進(jìn)行設(shè)計(jì)。由于引物和RNA序列特異性結(jié)合,每個(gè)目標(biāo)RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此,當(dāng)分析多種目標(biāo)時(shí),則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來(lái)就不相同,所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物,建議對(duì)退火溫度進(jìn)行優(yōu)化。
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